Çömlekçi Mahallesi, adını bölgede geçmiş dönemlerde sürdürülen çömlekçilik faaliyetlerinden almaktadır. Liman çevresindeki üretim ve ticaret hareketliliği nedeniyle mahalle, Osmanlı döneminde zanaat merkezlerinden biri olarak gelişmiştir. Cumhuriyet döneminde şehirleşmenin etkisiyle dönüşüm yaşayan mahalle, Trabzon’un tarihsel ticaret hafızasında önemli yere sahiptir.